В рамках программы военно-патриотического воспитания и профориентационной работы среди обучающейся молодежи региона УФСБ взаимодействует с образовательными учреждениями, подведомственными департаменту образования администрации области.

Так, в течение 2017-2018 учебного года сотрудники управления провели для подростков ряд занятий по военно-прикладным видам спорта, интеллектуальные игры, конференции и «круглые столы», посвященные памятным датам российской истории. Проведены литературно-художественный конкурс и фестиваль «На страже безопасности и чести».
Участие в них приняли воспитанники Томского, Колпашевского, Северского кадетских корпусов, а также ученики образовательных учреждений Томска, Северска, Асино, Колпашево. Всего более 200 человек. Ко всем мероприятиям военно-патриотического характера привлекались ветераны органов государственной безопасности.
Заключительным событием учебного года в профильных классах УФСБ стал волейбольный чемпионат, посвященный 100-летию со дня образования пограничных органов ФСБ России (отмечается 28 мая).  Главный приз этих соревнований - переходящий Кубок памяти пограничников, погибших при исполнении служебного долга. Обладателем кубка нынче стала команда Томского кадетского корпуса.