С 1 июля она реорганизуется путем присоединения к Кемеровской таможне.
Асиновский таможенный пост, Томский таможенный пост и Томский таможенный пост (Центр электронного декларирования) будут переподчинены Кемеровской таможне. Им будут присвоены новые коды.
К 2021 году в Сибири практически все декларирование будет осуществляться в Сибирской электронной таможне, открывшейся в августе 2019 года в Красноярске.
Остальные таможни региона приобретут статус таможен фактического контроля. Они будут осуществлять закрытие таможенного транзита, проводить таможенные досмотры, использовать предусмотренные Таможенным кодексом Евразийского экономического союза формы и меры обеспечения фактического контроля, будут контролировать декларирование на бумажных носителях отдельных товаров и таможенных процедур, а также осуществлять контроль после выпуска товаров.